MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 35241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319774952
2	NC_014922	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774952
3	NC_014922	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
4	NC_014922	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
5	NC_014922	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	319774952
6	NC_014922	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	319774952
7	NC_014922	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774952
8	NC_014922	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774952
9	NC_014922	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
10	NC_014922	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	319774952
11	NC_014922	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774952
12	NC_014922	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774952
13	NC_014922	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
14	NC_014922	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774952
15	NC_014922	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
16	NC_014922	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
17	NC_014922	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	319774952
18	NC_014922	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
19	NC_014922	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319774952
20	NC_014922	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
21	NC_014922	TCAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	0 %	25 %	319774953
22	NC_014922	TTGC	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	319774953
23	NC_014922	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
24	NC_014922	AGCA	2	8	1501	1508	50 %	0 %	25 %	25 %	319774953
25	NC_014922	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774953
26	NC_014922	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
27	NC_014922	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
28	NC_014922	CAATT	2	10	1633	1642	40 %	40 %	0 %	20 %	319774953
29	NC_014922	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
30	NC_014922	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
31	NC_014922	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
32	NC_014922	ATTT	2	8	1747	1754	25 %	75 %	0 %	0 %	319774953
33	NC_014922	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
34	NC_014922	CTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	0 %	25 %	319774953
35	NC_014922	T	6	6	1883	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	319774953
36	NC_014922	TC	3	6	1894	1899	0 %	50 %	0 %	50 %	319774953
37	NC_014922	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774953
38	NC_014922	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774953
39	NC_014922	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
40	NC_014922	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
41	NC_014922	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
42	NC_014922	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
43	NC_014922	G	6	6	2231	2236	0 %	0 %	100 %	0 %	319774953
44	NC_014922	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
45	NC_014922	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774953
46	NC_014922	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
47	NC_014922	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
48	NC_014922	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774953
49	NC_014922	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
50	NC_014922	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
51	NC_014922	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
52	NC_014922	ATTT	2	8	2569	2576	25 %	75 %	0 %	0 %	319774953
53	NC_014922	AT	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	319774953
54	NC_014922	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774953
55	NC_014922	AT	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	319774953
56	NC_014922	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
57	NC_014922	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
58	NC_014922	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
59	NC_014922	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
60	NC_014922	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
61	NC_014922	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774953
62	NC_014922	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	319774953
63	NC_014922	GCAA	2	8	2974	2981	50 %	0 %	25 %	25 %	319774953
64	NC_014922	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
65	NC_014922	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
66	NC_014922	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
67	NC_014922	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
68	NC_014922	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
69	NC_014922	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	319774954
70	NC_014922	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	319774954
71	NC_014922	A	6	6	3301	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	319774954
72	NC_014922	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	319774954
73	NC_014922	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
74	NC_014922	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
75	NC_014922	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
76	NC_014922	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	319774954
77	NC_014922	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
78	NC_014922	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
79	NC_014922	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774954
80	NC_014922	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
81	NC_014922	GAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774954
82	NC_014922	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
83	NC_014922	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
84	NC_014922	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774955
85	NC_014922	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774955
86	NC_014922	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774955
87	NC_014922	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774955
88	NC_014922	TC	4	8	4033	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	319774955
89	NC_014922	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774955
90	NC_014922	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	319774955
91	NC_014922	TTTCCT	2	12	4615	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
92	NC_014922	T	6	6	4733	4738	0 %	100 %	0 %	0 %	319774956
93	NC_014922	CTCG	2	8	4753	4760	0 %	25 %	25 %	50 %	319774956
94	NC_014922	TAAAA	2	10	4770	4779	80 %	20 %	0 %	0 %	319774956
95	NC_014922	CCAA	2	8	4806	4813	50 %	0 %	0 %	50 %	319774956
96	NC_014922	T	7	7	4930	4936	0 %	100 %	0 %	0 %	319774956
97	NC_014922	AAG	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774956
98	NC_014922	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
99	NC_014922	AGG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774956
100	NC_014922	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774956
101	NC_014922	CG	3	6	5125	5130	0 %	0 %	50 %	50 %	319774956
102	NC_014922	TGT	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774956
103	NC_014922	TA	3	6	5183	5188	50 %	50 %	0 %	0 %	319774956
104	NC_014922	AGC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774956
105	NC_014922	ATT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
106	NC_014922	TAT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
107	NC_014922	TGC	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774957
108	NC_014922	A	7	7	8617	8623	100 %	0 %	0 %	0 %	319774957
109	NC_014922	TGA	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
110	NC_014922	CAA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
111	NC_014922	AGA	2	6	8807	8812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
112	NC_014922	CAG	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
113	NC_014922	AGC	2	6	8906	8911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
114	NC_014922	CAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
115	NC_014922	ATA	2	6	8926	8931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774957
116	NC_014922	GAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
117	NC_014922	ATG	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
118	NC_014922	GAT	2	6	9228	9233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
119	NC_014922	GAA	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
120	NC_014922	ATTT	2	8	9299	9306	25 %	75 %	0 %	0 %	319774957
121	NC_014922	AGA	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
122	NC_014922	A	6	6	9325	9330	100 %	0 %	0 %	0 %	319774957
123	NC_014922	CCA	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774958
124	NC_014922	ATA	2	6	9420	9425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
125	NC_014922	T	6	6	9458	9463	0 %	100 %	0 %	0 %	319774958
126	NC_014922	CT	3	6	9489	9494	0 %	50 %	0 %	50 %	319774958
127	NC_014922	AAT	2	6	9556	9561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
128	NC_014922	ATT	2	6	9660	9665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
129	NC_014922	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
130	NC_014922	T	6	6	9706	9711	0 %	100 %	0 %	0 %	319774958
131	NC_014922	TGCT	2	8	9741	9748	0 %	50 %	25 %	25 %	319774958
132	NC_014922	ATA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
133	NC_014922	GCT	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
134	NC_014922	TTG	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774959
135	NC_014922	TGA	2	6	9849	9854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774959
136	NC_014922	TGC	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
137	NC_014922	GCGA	2	8	9880	9887	25 %	0 %	50 %	25 %	319774959
138	NC_014922	T	6	6	10025	10030	0 %	100 %	0 %	0 %	319774959
139	NC_014922	CAA	2	6	10058	10063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774959
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142	NC_014922	TAT	2	6	10380	10385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
143	NC_014922	TAT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
144	NC_014922	ACAA	2	8	10551	10558	75 %	0 %	0 %	25 %	319774960
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146	NC_014922	A	6	6	10656	10661	100 %	0 %	0 %	0 %	319774960
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153	NC_014922	CG	3	6	10949	10954	0 %	0 %	50 %	50 %	319774960
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157	NC_014922	TCA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
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159	NC_014922	CCGC	2	8	11526	11533	0 %	0 %	25 %	75 %	319774961
160	NC_014922	T	7	7	11545	11551	0 %	100 %	0 %	0 %	319774961
161	NC_014922	ATTT	2	8	11582	11589	25 %	75 %	0 %	0 %	319774961
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248	NC_014922	A	6	6	16129	16134	100 %	0 %	0 %	0 %	319774965
249	NC_014922	AGC	2	6	16143	16148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774965
250	NC_014922	TTTAG	2	10	16159	16168	20 %	60 %	20 %	0 %	319774965
251	NC_014922	GTCGT	2	10	16220	16229	0 %	40 %	40 %	20 %	319774965
252	NC_014922	TAA	2	6	16293	16298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774965
253	NC_014922	TTC	2	6	16406	16411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774965
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255	NC_014922	A	6	6	16449	16454	100 %	0 %	0 %	0 %	319774965
256	NC_014922	AAAC	2	8	16551	16558	75 %	0 %	0 %	25 %	319774965
257	NC_014922	CTTA	2	8	16615	16622	25 %	50 %	0 %	25 %	319774965
258	NC_014922	GTT	2	6	16666	16671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774965
259	NC_014922	TAAA	2	8	16701	16708	75 %	25 %	0 %	0 %	319774965
260	NC_014922	A	8	8	16781	16788	100 %	0 %	0 %	0 %	319774966
261	NC_014922	T	7	7	16814	16820	0 %	100 %	0 %	0 %	319774966
262	NC_014922	ATT	2	6	16854	16859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774966
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264	NC_014922	A	7	7	16873	16879	100 %	0 %	0 %	0 %	319774966
265	NC_014922	T	6	6	17086	17091	0 %	100 %	0 %	0 %	319774966
266	NC_014922	TTA	2	6	17100	17105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774966
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269	NC_014922	ATG	2	6	17224	17229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774966
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281	NC_014922	TG	3	6	17878	17883	0 %	50 %	50 %	0 %	319774967
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390	NC_014922	ACC	2	6	24643	24648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774972
391	NC_014922	AGCA	2	8	24676	24683	50 %	0 %	25 %	25 %	319774972
392	NC_014922	AATA	2	8	24764	24771	75 %	25 %	0 %	0 %	319774972
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